恭喜陈子浩、王晓悦、王长虎的文章“聚类分析中的特征筛选”在《中国科学：数学》正式发表！该研究聚焦单细胞 RNA 测序与空间转录组数据中高维、稀疏和高噪声带来的特征筛选难题，系统介绍了相关生物信息学和统计学方法，总结了该领域仍待解决的问题，并展望了未来研究方向。

恭喜欧阳林坤顺利完成博士论文答辩，黄雨霏、张子慧、冉清华顺利完成硕士论文答辩，祝欧阳林坤博士、黄雨霏硕士、张子慧硕士、冉清华硕士鹏程万里！

恭喜宣弘获得2026-2027年度校长奖学金！

恭喜张子慧、王啸辰、宣弘的文章"Spatial-aware detection of copy number alterations from spatial transcriptomics using SpaCNA"在Nature子刊Nature Communications正式发表！该研究提出了一种专为空间转录组数据设计的拷贝数变异检测算法——SpaCNA，通过有效整合空间转录组的多模态信息，实现了稳健准确的CNA检测。在实际肿瘤样本中，该工具成功勾勒出清晰的肿瘤边界，解析了肿瘤亚克隆结构，并在3D样本中揭示了肿瘤克隆的演化轨迹，为解析肿瘤空间异质性提供了有力工具。

恭喜黄思源、冉清华、唐俊杰、王啸辰的文章“SpaNiche: spatial niche analysis to explore colocalization patterns and cellular interactions in spatial transcriptomics data”在Genome Biology正式发表！该研究提出了一种识别空间细胞生态位的方法，通过图正则化联合非负矩阵分解，整合细胞丰度和配体-受体信号，首次实现了从多空间尺度系统解析细胞共定位模式，并在结直肠癌、前列腺癌和阿尔兹海默症等多个数据集中展现出超越现有方法的性能。

恭喜唐俊杰、陈子浩、钱坤的文章“The interpretable multimodal dimension reduction framework SpaHDmap enhances resolution in spatial transcriptomics”在 Nature 子刊 Nature Cell Biology 正式发表！ 该研究针对空间转录组数据空间分辨率受限、技术噪声较大以及跨切片、跨样本联合建模困难等问题，提出了一种可解释的多模态空间转录组降维分析框架 SpaHDmap，通过融合基因表达数据与高分辨率组织学图像信息，构建高分辨率基因表达嵌入表示，从而提升精细组织结构与空间生物过程的解析能力，并支持多切片、多样本及不同空间转录组平台的一致建模。

恭喜钱坤获得2025-2026学年北京国际数学研究中心“北大数学研究生奖”！

恭喜栗知非获得国家自然科学基金青年学生基础研究项目（本科生）！

恭喜王啸辰顺利完成博士论文答辩，陈宣玮顺利完成硕士论文答辩，祝王啸辰博士、陈宣玮硕士鹏程万里！

恭喜黄雨霏、王长虎的文章“A Generic Family of Graphical Models: Diversity, Efficiency, and Heterogeneity”在Proceedings of the Forty-second International Conference on Machine Learning (ICML 2025)发表！ 该研究针对传统网络推断方法在高维、离散及异质数据下的局限，提出了一套统一且高效的图模型框架。

恭喜陈宣玮、冉清华的文章“Benchmarking algorithms for spatially variable gene identification in spatial transcriptomics”在 Bioinformatics 上正式发表！ 该研究利用74个真实数据集对目前现有的识别空间可变基因（svg）计算方法从准确性、统计有效性和下游分析影响等方面进行了全面的基准测试，并为用户提供合理化建议。

恭喜王啸辰的文章“Detecting copy number alterations from single-cell chromatin sequencing data by AtaCNA”在 Cell 子刊 Cell Reports Methods 成功发表！ 该研究聚焦肿瘤细胞中的染色体拷贝数变异现象，设计了一套从单细胞ATAC测序数据高效检测此种变异的算法流程，命名为AtaCNA。该研究还利用拷贝数图谱分析了多个肿瘤样本内部的亚克隆细胞群，揭示了不同层面异质性对于肿瘤发展的潜在影响。

恭喜王长虎、黄思源顺利完成博士论文答辩，祝王长虎博士、黄思源博士鹏程万里！

恭喜肖非依、唐俊杰、胡波顺利完成博士论文答辩，祝肖非依博士、唐俊杰博士、胡波博士鹏程万里！

恭喜金子捷、李嘉欣顺利完成博士论文答辩，希望金子捷博士、李嘉欣博士毕业后能够取得更优秀的成果！

恭喜王涵的文章“The shaping of cancer genomes with regional impact of mutation processes”被学术期刊 Experimental & Molecular Medicine 接受发表！

恭喜石阳的文章“Single-Cell Transcriptomic Analysis Suggests Two Molecularly Subtypes of Intrahepatic Cholangiocarcinoma”在 Nature 子刊 Nature Communications 正式发表！

恭喜金子捷的文章“Single cell gene fusion detection by scFusion”在 Nature 子刊 Nature Communications 正式发表！

恭喜王涵顺利完成博士论文答辩，祝王涵博士鹏程万里！

恭喜武林杰的文章“Genomics landscape of 185 Streptococcus thermophilus and identification of fermentation biomarkers”在Food Research International 正式发表！

恭喜石阳、武林杰顺利完成博士论文答辩，祝石阳博士、武林杰博士毕业后能够取得更优秀的成果！

恭喜武林杰的文章 “CNV-BAC: Copy number Variation Detection in Bacterial Circular Genome”在 Bioinformatics 发表！

恭喜陈冲的文章 “scRMD: Imputation for single cell RNA-seq data via robust matrix decomposition”在 Bioinformatics 发表！

席瑞斌组与高强教授组合作文章“Global immune characterization of HBV/HCV-related hepatocellular carcinoma identifies macrophage and T-cell subsets associated with disease progression”在 Cell Discovery 发表！

席瑞斌组与刘芝华教授组合作文章“Whole-genome sequencing of 508 patients identifies key molecular features associated with poor prognosis in esophageal squamous cell carcinoma”在 Cell Research 发表！

席瑞斌组与席建忠教授合作文章“Patient-derived tumor-like cell clusters for drug testing in cancer therapy”在 Science 子刊 Science Translational Medicine 发表！

席瑞斌组与哈佛大学合作文章“Comprehensive analysis of chromothripsis in 2,658 human cancers using whole-genome sequencing”在Nature 子刊 Nature Genetics 发表！

恭喜陈冲、刘芸顺利完成博士论文答辩，祝陈冲博士、刘芸博士鹏程万里！

席瑞斌组的面上项目“基于单细胞转录组测序的网络分析方法和理论“日前获批。

夏禹超、刘芸的学术论文“Detecting virus integration sites based on multiple related sequencing data by VirTect” 在BMC Medical Genomics 发表！